O fluxo do APOIA funciona da seguinte forma:

• Quando o aluno completa cinco faltas injustificadas seguidas ou sete alternadas em 30 dias, começa o fluxo do Programa APOIA. Os professores informam à gestão escolar os nomes dos alunos que tiveram as e a gestão escolar faz a primeira busca ativa através de um contato com a família por telefone, SMS, WhatsApp ou visita domiciliar. Se não obtiver êxito no primeiro contato, o assistente de educação (AE) registra o aluno faltoso no Sistema do APOIA Online.
• A partir do registro, o Conselho Tutelar é acionado para localizar o aluno e conduzi-lo de volta para a escola, em um prazo de 15 dias. Caso esta segunda tentativa também não gere resultados, o caso é encaminhado para o Ministério Público.
• Se o Conselho Tutelar não resolveu a situação, o caso é encaminhado ao Ministério Público. lá, o Promotor de Justiça chama os pais para alertar sobre a importância da matrícula e frequência e identifica os reais motivos desta evasão escolar.
• Paralela à esta ação que tem início no ambiente escolar, os agentes comunitários de saúde e os assistentes sociais também podem contribuir para a identificação e registro de crianças e adolescentes em idade escolar sem matrícula, que abandonaram ou evadiram;